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苹果短信删除后又出现可能有以下几种原因。
1、可能是使用了备份恢复数据，如使用iTunes备份恢复后，之前的短信数据被同步到了新的设备中，此时可以检查是否开启了备份恢复功能，并确认是否使用了相同的Apple ID登录iCloud，如果确实使用了备份恢复功能，可以尝试关闭该功能或使用不同的Apple ID登录iCloud。
2、可能是短信没有真正被删除，只是被放置在了某个文件夹或某个特定的位置，此时可以尝试搜索短信内容或关键词，看看是否能找到已删除的短信，如果找到了，可以将其移动到正确的位置或删除。
3、如果设备使用的是同一个Apple ID并且都开启了iCloud同步功能，那么在一台设备上删除短信后，这些短信可能会出现在另一台设备上，此时需要检查所有设备的设置，确保没有误操作同步操作，如果确认是同步问题导致的短信再次出现，可以关闭iCloud中的短信同步功能。
苹果短信删除后又出现的原因可能是多方面的，需要根据具体情况进行排查和解决，如果以上方法都无法解决问题，建议联系苹果官方客服寻求帮助。